类型映射不一致
作者: dakpinaroglu创建于 2023年1月29日更新于 2026年1月14日
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由restypes'制成的restype-order'与“HHBLITS-AA-TO-ID”所储存的数值不符。 例如,在读取 pdb 时使用 “ pdb from string” 返回“ G” 的值 7 。 后来,当aatype被转换为字符串类型或最终为一热时,"ID TO HHBLITS AA"将返回7,而不是"G"的值"I". 辞典不一. HHBLITS-AA TO ID'将不使用restype-order',而是将地图映射为Atype,同时与ID TO-HHBLITS-AA'保持一致,用于在蛋白质.py'中读取pdbs。 这也将消除使用`应撤销的'抑制剂。 MAP HHBLITS ATYPE TO-OUR ATYPE". 星洲网.
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内容来源: google-deepmind/alphafold