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开源

AlphaFold 2的开源代码.

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工具介绍

AlphaFold 2的开源代码.

阿尔法福德这个包提供了AlphaFold v2的推论管道的实施. 为了简洁起见,我们在本文件中将这个模型称为AlphaFold。我们还规定:1. 实施AlphaFold-Multimer。这代表着一项正在进行中的工作,AlphaFold-Multimer预计不会像我们的单体AlphaFold系统那样稳定. 阅读如何更新和更新代码的指南. 2. 载有更新后AlphaFold v2.3.0的模型和推论程序的技术说明。 3. 一套CASP15基线预测以及任何人工干预的文件。任何公布使用此源代码或模型参数产生的调查结果的出版物,均应引用AlphaFold纸张,如果适用,则引用AlphaFold-Multimer纸张. 另请参阅补充资料,以详细说明该方法。哟..

核心特点

•Setup running
•Install aria2c. On most Linux distributions it is available via the
•Please use the script scripts/download_all_data.sh to download and set
•Note: The download directory <DOWNLOAD_DIR> should *not* be a
•It is possible to run AlphaFold with reduced databases; please refer to
•PDB (structures in the mmCIF format),
•PDB seqres – only for AlphaFold-Multimer,
•UniRef30 (FKA UniClust30),
•UniProt – only for AlphaFold-Multimer,
•UniRef90.

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