用 Python 和 zig 绑定的 C++ 库和命令行工具,用于解析和操作 VCF 文件
Vcflib 和相关工具是生物信息学领域用于处理 VCF 变异调用格式的主要工具。请参阅 用于处理 VCF 变异调用格式的自由软件工具系列: vcflib、bio-vcf、cyvcf2、hts-nim 和 slivar。 Garrison E, Kronenberg ZN, Dawson ET, Pedersen BS, Prins P (2022), PLoS Comput Biol 18(5): e1009123. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009123 (本页末尾有 bibtex 参考)
2025 年 5 月: 修复、更新和可下载的二进制文件。请参阅 RELEASE_NOTES.md 2024 年 11 月: 一个全新的版本,主要包含与全基因组相关的修复。
2023 年 1 月：这是 vcflib 的第一个 Humpty Dumpty 版本：vcfcreatemulti 是 vcfwave 的自然配套工具。通常，变异检测器并不完美。
我们通过包含最先进的 biWFA 波前对齐器来创建这些工具。这些工具特别适用于结构变异调用器和全基因组基因型器的输出，例如人类全基因组参考联盟 (HPRC) 使用的，因为 ALT 片段相互重叠。
暂无开放 Issues，或尚未同步最近议题。