重构!: 移除对内存文件存储的依赖

与 https://GitHub.com/renovatebot/renovate/issues/46062 相关,在某些情况下,Renovate 会在内存中操作文件,然后 _在某个时候_ 将其保存到磁盘。正如 #44615 中所示,这可能导致需要重新检查文件。通过在下一个主要版本中重构,确保所有文件更改都被保存到磁盘,而不是存储在内存中,可以减少这种"陷阱"。