使用重复图对单分子测序读取进行全新组装
Flye 是一个用于单分子测序读取（如 PacBio 和 Oxford Nanopore Technologies 生成的读取）的全新组装程序。它适用于各种数据集，从小型细菌项目到大型哺乳动物级别的组装。该包代表了一个完整的流程：它将原始 PacBio/ONT 读取作为输入，并输出精修的连续片段。Flye 还具有用于组装群落基因组的特殊模式。
如果您使用 Flye / metaFlye 组装异源细菌基因组或群落基因组，可以考虑使用 strainy 来调用和量化异源性并显示坍塌菌株。
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