将文件关联到工作区

在我们的设置中,由于第三方工具,我们的根目录下有一个目录,每个应用都有一个配置文件。由于这些文件不在应用的工作区中,不会触发变更集包含建议。是否有兴趣将某些文件/目录链接到特定的工作区之外?